Naslov diplomskega dela: Analiza uporabe hiperelipsoidov pri ocenjevanju robustnosti biološkega procesorja

Povzetek:

V okviru diplomske naloge predstavimo postopek analize robusnosti modelov sintetičnih bioloških gradnikov. Postopek analize demonstiramo na primeru modela biološkega procesorja. Robustnost ocenimo na podlagi volumna prostora dopustnih parametrov v visokodimenzionalnem prostoru. Ta volumen izračunamo z uporabo genetskih algoritmov, metode glavnih komponent, nazadnje pa z metodo Monte Carlo. V diplomski nalogi demonstriramo pomembnost učinkovitega reduciranja omejujočega prostora možnih Monte Carlo vzorčenj za pridobitev natančnejšega rezultata z manj ponovitvami. Namesto hiperkvadra predlagamo uporabo hiperelipsoidov. Implementiramo metodo naključnega enakomernega vzorčenja znotraj danega hiperelipsoida. Primerjamo tudi dva pristopa za računanje omejujočega hiperelipsoida s čim manjšim volumnom. Z uporabo teh metod demonstriramo prednosti in slabosti uporabe hiperelipsoidov kot alternativi hiperkvadra pri izbiri omejujočih teles. Pri nekaterih množicah dopustnih parametrov vodi manjši volumen omejujočega hiperelipsoida k redukciji potrebnih vzorčenj Monte Carlo za več kot magnitudo.

Termin zagovora: ponedeljek, 14. 9. 2020, ob 10.00

Mentor: izr. prof. dr. Miha Moškon

Somentor: asist. Žiga Pušnik

Komisija za zagovor:​

izr. prof. dr. Iztok Lebar Bajec (predsednik),

izr. prof. dr. Miha Moškon (mentor),

prof. dr. Miha Mraz (član).

Povezava do video kanala, po katerem se bo prenašal zagovor in ga bo možno spremljati, bo dodana najkasneje na dan zagovora (predvidoma 30 minut pred terminom izvedbe zagovora) na spletni strani: https://ucilnica.fri.uni-lj.si/course/view.php?id=358.