07.
jul
Zagovor magistrskega dela: Aljaž Šmaljcelj
ob 10:00

Naslov magistrskega dela: Proceduralno generiranje oblik mitohondrijev in Golgijevih aparatov z uporabo statističnih modelov

 

Povzetek: 

Razumevanje morfologije celičnih organelov je eden izmed pogojev razumevanja njihovega delovanja. Oblika lahko odgovori na vprašanje, zakaj določeni procesi potekajo na določen način. V delu predstavimo statistično modeliranje oblike mitohondrija in Golgijevega aparata. Za vsakega od organelov izmerimo razdalje do karakterističnih točk na njihovih površjih in jih statistično analiziramo. Grobo obliko mitohondrija izpeljemo z ekstrakcijo skeleta in merjenja razdalje iz točk skeleta do površja. Pri Golgijevem aparatu iz celotne oblike identificiramo cisterne in za vsako izmerimo razdalje iz njenega centra do roba v karakteričnih smereh. Dobljene rezultate uporabimo za izpeljavo novih oblik, kjer nove razdalje vzorčimo iz statistične porazdelitve merjenih razdalj. Obliko dodatno prilagodimo s spreminjanjem vhodnih parametrov. Nove oblike preverimo s primerjavo opisanih razdalj s primerki testne množice. Dodatno poskusimo s kombinacijo različnih vhodnih parametrov izpeljati vizualno čim bolj podobno obliko primerka, ki ni bil vključen v statistično analizo. Oblike mitohondrijev predstavljajo dober približek realni obliki, medtem ko oblike Golgijevega aparata nekoliko manj, za kar bi lahko bile krive številne predpostavke in poenostavitve oblike tekom statistične analize.

 

Mentor: doc. dr. Ciril Bohak

 

Komisija za zagovor: 

izr. prof. dr. Tomaž Curk, predsednik

doc. dr. Tomaž Hočevar, član

prof. dr. Blaž Zupan, član

 

Prostor: Diplomska soba